平成28年度第3回 バイオインフォマティクス研究会を開催しました
平成28年度第3回 バイオインフォマティクス研究会を開催しました
【実施日】 2016年9月12日 (月) 17:00～18:00
【会 場】 横浜市立大学 福浦キャンパス 看護棟4階 M401実習室
【来場者】 6名
【内 容】
演題：「HTSeqによるタグ数のカウント」
講師：先端医科学研究センター バイオインフォマティクス研究室 准教授 中林 潤 先生
要旨：前回までの講義でマウスのゲノム上にマッピングしたシーケンスデータを使って、読まれた配列のタグ数をカウントした。カウントにはタグ計数用のアプリケーションであるHTSeqを使った。結果をテキストファイルとして出力し、エクセルで開いてタグ数を確認した。タグの計数された遺伝子をIGVで表示して、タグの位置を確認した。
お問い合わせ先
先端医科学研究センター バイオインフォマティクス研究室 准教授 中林 潤
内線：2321
E-mail：nakabaya@yokohama-cu.ac.jp