第12回バイオインフォマティクス研究会を開催しました
第12回バイオインフォマティクス研究会を開催しました
【実施日】 2014年５月２６日 (月) 1７:00～1８:00
【会 場】 横浜市立大学 福浦キャンパス 先端医科学研究棟 503号室（会議室）
【来場者】 24名
【内 容】
演題：「GO termに基づくPathway解析について」
講師：免疫学 特任准教授 中林 潤 先生
要旨： GO term、Pathway databaseを使って遺伝子の機能を推定する方法を解説した。GO termの出現頻度が超幾何分布に従うと仮定し、統計学的な有意性を判定する方法について解説した。
また実際に解析を行う際の作業を例示した。GEOデータベースからRunx2 K/Oマウスのマイクロアレイデータを取得し、WT-K/Oマウス間で発現が変動している遺伝子を抽出、それらの遺伝子の持つGOタームからRunx2の機能を推定する作業を例示した。
最後に横浜市大医学部内LANに接続した端末から、Bioinformatics portal siteのリンクから、各種web toolを使って解析を行う方法を説明した。
