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論文
2024年
- Membrane structure-responsive lipid scrambling by TMEM63B to control plasma membrane lipid distribution.
Yugo Miyata, Katsuya Takahashi, Yongchan Lee, Cheryl S. Sultan, Risa Kuribayashi, Masatomo Takahashi, Kosuke Hata, Takeshi Bamba, Yoshihiro Izumi, Kehong Liu, Tomoko Uemura, Norimichi Nomura, So Iwata, Shigekazu Nagata, Tomohiro Nishizawa & Katsumori Segawa
Nature Structural & Molecular Biology 2024年10月18日 - The unique allosteric property of crocodilian haemoglobin elucidated by cryo-EM
Katsuya Takahashi, Yongchan Lee, Angela Fago, Naim M. Bautista, Jay F. Storz, Akihiro Kawamoto, Genji Kurisu, Tomohiro Nishizawa & Jeremy R. H. Tame
Nature communications 15, 6505 2024年8月2日 - Cryo-EM structures elucidate the multiligand receptor nature of megalin.
Sawako Goto, Akihisa Tsutsumi, Yongchan Lee, Michihiro Hosojima, Hideyuki Kabasawa, Koichi Komochi, Satoru Nagatoishi, Kazuya Takemoto, Kouhei Tsumoto, Tomohiro Nishizawa …
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 121(22) e2318859121 2024年5月28日 - Structure of the human Bre1 complex bound to the nucleosome.
Shuhei Onishi, Kotone Uchiyama, Ko Sato, Chikako Okada, Shunsuke Kobayashi, Keisuke Hamada, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki, Kazuhiro Ogata, Toru Sengoku
Nature communications 15(1) 2580-2580 2024年3月22日 - Bicarbonate signalling via G protein-coupled receptor regulates ischaemia-reperfusion injury.
Airi Jo-Watanabe, Toshiki Inaba, Takahiro Osada, Ryota Hashimoto, Tomohiro Nishizawa, Toshiaki Okuno, Sayoko Ihara, Kazushige Touhara, Nobutaka Hattori, Masatsugu Oh-Hora …
Nature communications 15(1) 1530-1530 2024年2月27日
2023年
- Twisting and Protonation of Retinal Chromophore Regulate Channel Gating of Channelrhodopsin C1C2
Keisei Shibata, Kazumasa Oda, Tomohiro Nishizawa, Yuji Hazama, Ryohei Ono, Shunki Takaramoto, Reza Bagherzadeh, Hiromu Yawo, Osamu Nureki, Keiichi Inoue …
Journal of the American Chemical Society 145(19) 10779-10789 2023年5月2日 - Microcrystal electron diffraction (MicroED) structure determination of a mechanochemically synthesized co-crystal not affordable from solution crystallization
Toshiyuki Sasaki, Takanori Nakane, Akihiro Kawamoto, Tomohiro Nishizawa, Genji Kurisu
CrystEngComm 2023年 査読有り
2022年
- Cryo-EM structures of thylakoid-located voltage-dependent chloride channel VCCN1
Tatsuya Hagino, Takafumi Kato, Go Kasuya, Kan Kobayashi, Tsukasa Kusakizako, Shin Hamamoto, Tomoaki Sobajima, Yuichiro Fujiwara, Keitaro Yamashita, Hisashi Kawasaki, Andrés D. Maturana, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki
Nature Communications 13(1) 2022年12月 - RNA-triggered protein cleavage and cell growth arrest by the type III-E CRISPR nuclease-protease.
Kazuki Kato, Sae Okazaki, Cian Schmitt-Ulms, Kaiyi Jiang, Wenyuan Zhou, Junichiro Ishikawa, Yukari Isayama, Shungo Adachi, Tomohiro Nishizawa, Kira S Makarova, Eugene V Koonin, Omar O Abudayyeh, Jonathan S Gootenberg, Hiroshi Nishimasu
Science (New York, N.Y.) 378(6622) 882-889 2022年11月25日 - Cryo-EM structures of thermostabilized prestin provide mechanistic insights underlying outer hair cell electromotility
Haon Futamata, Masahiro Fukuda, Rie Umeda, Keitaro Yamashita, Atsuhiro Tomita, Satoe Takahashi, Takafumi Shikakura, Shigehiko Hayashi, Tsukasa Kusakizako, Tomohiro Nishizawa, Kazuaki Homma, Osamu Nureki
Nature Communications 13(6208) 2022年10月20日 - Ion transfer mechanisms in Mrp-type antiporters from high resolution cryoEM and molecular dynamics simulations
Yongchan Lee, Outi Haapanen, Anton Altmeyer, Werner Kühlbrandt, Vivek Sharma, Volker Zickermann
Nature Communications 13(1) 2022年10月14日 - Structure and function of H+/K+ pump mutants reveal Na+/K+ pump mechanisms
Victoria C. Young, Hanayo Nakanishi, Dylan J. Meyer, Tomohiro Nishizawa, Atsunori Oshima, Pablo Artigas, Kazuhiro Abe
Nature Communications 13(1) 2022年9月9日 - Structural insights into inhibitory mechanism of human excitatory amino acid transporter EAAT2
Takafumi Kato, Tsukasa Kusakizako, Chunhuan Jin, Xinyu Zhou, Ryuichi Ohgaki, LiLi Quan, Minhui Xu, Suguru Okuda, Kan Kobayashi, Keitaro Yamashita, Tomohiro Nishizawa, Yoshikatsu Kanai, Osamu Nureki
Nature Communications 13(1) 2022年8月11日 - Endogenous ligand recognition and structural transition of a human PTH receptor.
Kazuhiro Kobayashi, Kouki Kawakami, Tsukasa Kusakizako, Hirotake Miyauchi, Atsuhiro Tomita, Kan Kobayashi, Wataru Shihoya, Keitaro Yamashita, Tomohiro Nishizawa, Hideaki E Kato, Asuka Inoue, Osamu Nureki
Molecular cell 2022年8月4日 - Structure of the Dicer-2-R2D2 heterodimer bound to a small RNA duplex.
Sonomi Yamaguchi, Masahiro Naganuma, Tomohiro Nishizawa, Tsukasa Kusakizako, Yukihide Tomari, Hiroshi Nishimasu, Osamu Nureki
Nature 607(7918) 393-398 2022年7月 - Structure and engineering of the type III-E CRISPR-Cas7-11 effector complex
Kazuki Kato, Wenyuan Zhou, Sae Okazaki, Yukari Isayama, Tomohiro Nishizawa, Jonathan S. Gootenberg, Omar O. Abudayyeh, Hiroshi Nishimasu
Cell 185(13) 2324-2337.e16 2022年6月 - Structure of the type V-C CRISPR-Cas effector enzyme.
Nina Kurihara, Ryoya Nakagawa, Hisato Hirano, Sae Okazaki, Atsuhiro Tomita, Kan Kobayashi, Tsukasa Kusakizako, Tomohiro Nishizawa, Keitaro Yamashita, David A Scott, Hiroshi Nishimasu, Osamu Nureki
Molecular cell 82(10) 1865-1877 2022年5月19日 - Structural insights into the HBV receptor and bile acid transporter NTCP.
Jae-Hyun Park, Masashi Iwamoto, Ji-Hye Yun, Tomomi Uchikubo-Kamo, Donghwan Son, Zeyu Jin, Hisashi Yoshida, Mio Ohki, Naito Ishimoto, Kenji Mizutani, Mizuki Oshima, Masamichi Muramatsu, Takaji Wakita, Mikako Shirouzu, Kehong Liu, Tomoko Uemura, Norimichi Nomura, So Iwata, Koichi Watashi, Jeremy R H Tame, Tomohiro Nishizawa, Weontae Lee, Sam-Yong Park
Nature 606(7916) 1027-1031 2022年5月17日 - Ca2+-mediated higher-order assembly of heterodimers in amino acid transport system b0,+biogenesis and cystinuria
Yongchan Lee, Pattama Wiriyasermkul, Pornparn Kongpracha, Satomi Moriyama, Deryck J. Mills, Werner Kühlbrandt & Shushi Nagamori
Nature Communications 2022年5月16日 - PTH1Rの構造多形から明らかになったリガンド認識における分子相互基盤と持続的受容体活性化メカニズム
小林 和弘, 川上 耕季, 草木迫 司, 郷野 弘剛, 富田 篤弘, 小林 幹, 志甫谷 渉, 山下 恵太郎, 西澤 知宏, 加藤 英明, 井上 飛鳥, 濡木 理
日本薬理学会年会要旨集 95 2-YIA-66 2022年
2021年
- Cryo-EM of the ATP11C flippase reconstituted in Nanodiscs shows a distended phospholipid bilayer inner membrane around transmembrane helix 2.
Hanayo Nakanishi, Kenichi Hayashida, Tomohiro Nishizawa, Atsunori Oshima, Kazuhiro Abe
The Journal of biological chemistry 298(1) 101498-101498 2021年12月17日 - Cryo-EM reveals mechanistic insights into lipid-facilitated polyamine export by human ATP13A2.
Atsuhiro Tomita, Takashi Daiho, Tsukasa Kusakizako, Keitaro Yamashita, Satoshi Ogasawara, Takeshi Murata, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki
Molecular cell 81(23) 4799-4809 2021年12月2日 - Structural basis of the regulation of the normal and oncogenic methylation of nucleosomal histone H3 Lys36 by NSD2.
Ko Sato, Amarjeet Kumar, Keisuke Hamada, Chikako Okada, Asako Oguni, Ayumi Machiyama, Shun Sakuraba, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki, Hidetoshi Kono, Kazuhiro Ogata, Toru Sengoku
Nature communications 12(1) 6605-6605 2021年11月15日 - Gastric proton pump with two occluded K+ engineered with sodium pump-mimetic mutations.
Kazuhiro Abe, Kenta Yamamoto, Katsumasa Irie, Tomohiro Nishizawa, Atsunori Oshima
Nature communications 12(1) 5709-5709 2021年9月29日 - Structural basis of gating modulation of Kv4 channel complexes.
Yoshiaki Kise, Go Kasuya, Hiroyuki H Okamoto, Daichi Yamanouchi, Kan Kobayashi, Tsukasa Kusakizako, Tomohiro Nishizawa, Koichi Nakajo, Osamu Nureki
Nature 2021年9月22日 - Cryo-EM structure of the β3-adrenergic receptor reveals the molecular basis of subtype selectivity.
Chisae Nagiri, Kazuhiro Kobayashi, Atsuhiro Tomita, Masahiko Kato, Kan Kobayashi, Keitaro Yamashita, Tomohiro Nishizawa, Asuka Inoue, Wataru Shihoya, Osamu Nureki
Molecular cell 81(15) 3205-3215 2021年8月5日 - Cryo-EM structure of the human MT1-Gi signaling complex.
Hiroyuki H Okamoto, Hirotake Miyauchi, Asuka Inoue, Francesco Raimondi, Hirokazu Tsujimoto, Tsukasa Kusakizako, Wataru Shihoya, Keitaro Yamashita, Ryoji Suno, Norimichi Nomura, Takuya Kobayashi, So Iwata, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki
Nature structural & molecular biology 28(8) 694-701 2021年8月 - Time-resolved serial femtosecond crystallography reveals early structural changes in channelrhodopsin.
Kazumasa Oda, Takashi Nomura, Takanori Nakane, Keitaro Yamashita, Keiichi Inoue, Shota Ito, Johannes Vierock, Kunio Hirata, Andrés D Maturana, Kota Katayama, Tatsuya Ikuta, Itsuki Ishigami, Tamaki Izume, Rie Umeda, Ryuun Eguma, Satomi Oishi, Go Kasuya, Takafumi Kato, Tsukasa Kusakizako, Wataru Shihoya, Hiroto Shimada, Tomoyuki Takatsuji, Mizuki Takemoto, Reiya Taniguchi, Atsuhiro Tomita, Ryoki Nakamura, Masahiro Fukuda, Hirotake Miyauchi, Yongchan Lee, Eriko Nango, Rie Tanaka, Tomoyuki Tanaka, Michihiro Sugahara, Tetsunari Kimura, Tatsuro Shimamura, Takaaki Fujiwara, Yasuaki Yamanaka, Shigeki Owada, Yasumasa Joti, Kensuke Tono, Ryuichiro Ishitani, Shigehiko Hayashi, Hideki Kandori, Peter Hegemann, So Iwata, Minoru Kubo, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki
eLife 10 2021年3月23日 - Structure of the miniature type V-F CRISPR-Cas effector enzyme.
Satoru N Takeda, Ryoya Nakagawa, Sae Okazaki, Hisato Hirano, Kan Kobayashi, Tsukasa Kusakizako, Tomohiro Nishizawa, Keitaro Yamashita, Hiroshi Nishimasu, Osamu Nureki
Molecular cell 81(3) 558-570 2021年2月4日 - Mitochondrial sorting and assembly machinery operates by β-barrel switching.
Hironori Takeda, Akihisa Tsutsumi, Tomohiro Nishizawa, Caroline Lindau, Jon V Busto, Lena-Sophie Wenz, Lars Ellenrieder, Kenichiro Imai, Sebastian P Straub, Waltraut Mossmann, Jian Qiu, Yu Yamamori, Kentaro Tomii, Junko Suzuki, Takeshi Murata, Satoshi Ogasawara, Osamu Nureki, Thomas Becker, Nikolaus Pfanner, Nils Wiedemann, Masahide Kikkawa, Toshiya Endo
Nature 590(7844) 163-169 2021年2月 - Cryo-EM structures of Toll-like receptors in complex with UNC93B1.
Hanako Ishida, Jinta Asami, Zhikuan Zhang, Tomohiro Nishizawa, Hideki Shigematsu, Umeharu Ohto, Toshiyuki Shimizu
Nature structural & molecular biology 28(2) 173-180 2021年2月
2020年
- Consensus mutagenesis approach improves the thermal stability of system xc- transporter, xCT, and enables cryo-EM analyses.
Kazumasa Oda, Yongchan Lee, Pattama Wiriyasermkul, Yoko Tanaka, Mizuki Takemoto, Keitaro Yamashita, Shushi Nagamori, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki
Protein science : a publication of the Protein Society 29(12) 2398-2407 2020年12月 査読有り - Transport Cycle of Plasma Membrane Flippase ATP11C by Cryo-EM.
Hanayo Nakanishi, Tomohiro Nishizawa, Katsumori Segawa, Osamu Nureki, Yoshinori Fujiyoshi, Shigekazu Nagata, Kazuhiro Abe
Cell reports 32(13) 108208-108208 2020年9月29日 - Cryo-EM structures of SERCA2b reveal the mechanism of regulation by the luminal extension tail.
Yuxia Zhang, Michio Inoue, Akihisa Tsutsumi, Satoshi Watanabe, Tomohiro Nishizawa, Kazuhiro Nagata, Masahide Kikkawa, Kenji Inaba
Science advances 6(33) eabb0147 2020年8月 - The structure of lipid nanodisc-reconstituted TRPV3 reveals the gating mechanism.
Hiroto Shimada, Tsukasa Kusakizako, T H Dung Nguyen, Tomohiro Nishizawa, Tomoya Hino, Makoto Tominaga, Osamu Nureki
Nature structural & molecular biology 27(7) 645-652 2020年7月 - Cryo-EM structures of calcium homeostasis modulator channels in diverse oligomeric assemblies.
Kanae Demura, Tsukasa Kusakizako, Wataru Shihoya, Masahiro Hiraizumi, Kengo Nomura, Hiroto Shimada, Keitaro Yamashita, Tomohiro Nishizawa, Akiyuki Taruno, Osamu Nureki
Science advances 6(29) eaba8105 2020年7月 査読有り - Cryo-EM structure of the volume-regulated anion channel LRRC8D isoform identifies features important for substrate permeation.
Ryoki Nakamura, Tomohiro Numata, Go Kasuya, Takeshi Yokoyama, Tomohiro Nishizawa, Tsukasa Kusakizako, Takafumi Kato, Tatsuya Hagino, Naoshi Dohmae, Masato Inoue, Kengo Watanabe, Hidenori Ichijo, Masahide Kikkawa, Mikako Shirouzu, Thomas J Jentsch, Ryuichiro Ishitani, Yasunobu Okada, Osamu Nureki
Communications biology 3(1) 240-240 2020年5月15日 査読有り - Structural insights into tetraspanin CD9 function.
Rie Umeda, Yuhkoh Satouh, Mizuki Takemoto, Yoshiko Nakada-Nakura, Kehong Liu, Takeshi Yokoyama, Mikako Shirouzu, So Iwata, Norimichi Nomura, Ken Sato, Masahito Ikawa, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki
Nature communications 11(1) 1606-1606 2020年3月30日 査読有り - Cryo-EM structure of the human PAC1 receptor coupled to an engineered heterotrimeric G protein.
Kazuhiro Kobayashi, Wataru Shihoya, Tomohiro Nishizawa, Francois Marie Ngako Kadji, Junken Aoki, Asuka Inoue, Osamu Nureki
Nature structural & molecular biology 27(3) 274-280 2020年3月 査読有り
2019年
- Cryo-EM structures capture the transport cycle of the P4-ATPase flippase.
Masahiro Hiraizumi, Keitaro Yamashita, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki
Science (New York, N.Y.) 365(6458) 1149-1155 2019年9月13日 査読有り - Cryo-EM structure of the human L-type amino acid transporter 1 in complex with glycoprotein CD98hc.
Yongchan Lee, Pattama Wiriyasermkul, Chunhuan Jin, Lili Quan, Ryuichi Ohgaki, Suguru Okuda, Tsukasa Kusakizako, Tomohiro Nishizawa, Kazumasa Oda, Ryuichiro Ishitani, Takeshi Yokoyama, Takanori Nakane, Mikako Shirouzu, Hitoshi Endou, Shushi Nagamori, Yoshikatsu Kanai, Osamu Nureki
Nature structural & molecular biology 26(6) 510-517 2019年6月 査読有り - Crystallization of the human tetraspanin protein CD9.
Rie Umeda, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki
Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications 75(Pt 4) 254-259 2019年4月1日 査読有り - Crystal structure of plant vacuolar iron transporter VIT1.
Takafumi Kato, Kaoru Kumazaki, Miki Wada, Reiya Taniguchi, Takanori Nakane, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Ryuichiro Ishitani, Koichi Ito, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki
Nature plants 5(3) 308-315 2019年3月 査読有り
2018年
- Crystal structures of human ETB receptor provide mechanistic insight into receptor activation and partial activation.
Wataru Shihoya, Tamaki Izume, Asuka Inoue, Keitaro Yamashita, Francois Marie Ngako Kadji, Kunio Hirata, Junken Aoki, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki
Nature communications 9(1) 4711-4711 2018年11月9日 査読有り - Toward Structural Understanding of Ligand Recognition by Lysophosphatidic Acid Receptor Lpa6
Taniguchi Reiya, Inoue Asuka, Sayama Misa, Yamashita Keitaro, Hirata Kunio, Yoshida Masahito, Nakada-Nakura Yoshiko, Otani Yuko, Kato Hideaki, Nishizawa Tomohiro, Doi Takayuki, Ohwada Tomohiko, Ishitani Ryuichiro, Aoki Junken, Nureki Osamu
PROTEIN SCIENCE 27 235-236 2018年11月 査読有り - Crystal structure of the red light-activated channelrhodopsin Chrimson.
Kazumasa Oda, Johannes Vierock, Satomi Oishi, Silvia Rodriguez-Rozada, Reiya Taniguchi, Keitaro Yamashita, J Simon Wiegert, Tomohiro Nishizawa, Peter Hegemann, Osamu Nureki
Nature communications 9(1) 3949-3949 2018年9月26日 査読有り - Free Energy Landscape for the Entire Transport Cycle of Triose-Phosphate/Phosphate Translocator
Mizuki Takemoto, Yongchan Lee, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki
Structure 26(9) 1284-1296.e4 2018年9月 査読有り - Cryo-EM structures of the human volume-regulated anion channel LRRC8.
Go Kasuya, Takanori Nakane, Takeshi Yokoyama, Yanyan Jia, Masato Inoue, Kengo Watanabe, Ryoki Nakamura, Tomohiro Nishizawa, Tsukasa Kusakizako, Akihisa Tsutsumi, Haruaki Yanagisawa, Naoshi Dohmae, Motoyuki Hattori, Hidenori Ichijo, Zhiqiang Yan, Masahide Kikkawa, Mikako Shirouzu, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki
Nature structural & molecular biology 25(9) 797-804 2018年9月 査読有り - プロテオリポソームを用いたリン酸輸送体の活性測定
李勇燦
蛋白質科学会アーカイブ 11 e087 2018年2月 査読有り,筆頭著者
2017年
- Structural basis for xenobiotic extrusion by eukaryotic MATE transporter.
Hirotake Miyauchi, Satomi Moriyama, Tsukasa Kusakizako, Kaoru Kumazaki, Takanori Nakane, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Naoshi Dohmae, Tomohiro Nishizawa, Koichi Ito, Takaaki Miyaji, Yoshinori Moriyama, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki
Nature communications 8(1) 1633-1633 2017年11月21日 査読有り - Structure of the triose-phosphate/phosphate translocator reveals the basis of substrate specificity
Yongchan Lee, Tomohiro Nishizawa, Mizuki Takemoto, Kaoru Kumazaki, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Ayumi Minoda, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki
Nature Plants 3(10) 825-832 2017年10月1日 査読有り - X-ray structures of endothelin ETB receptor bound to clinical antagonist bosentan and its analog.
Wataru Shihoya, Tomohiro Nishizawa, Keitaro Yamashita, Asuka Inoue, Kunio Hirata, Francois Marie Ngako Kadji, Akiko Okuta, Kazutoshi Tani, Junken Aoki, Yoshinori Fujiyoshi, Tomoko Doi, Osamu Nureki
Nature structural & molecular biology 24(9) 758-764 2017年9月 査読有り - Structural insights into ligand recognition by the lysophosphatidic acid receptor LPA6.
Reiya Taniguchi, Asuka Inoue, Misa Sayama, Akiharu Uwamizu, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Masahito Yoshida, Yoshiki Tanaka, Hideaki E Kato, Yoshiko Nakada-Nakura, Yuko Otani, Tomohiro Nishizawa, Takayuki Doi, Tomohiko Ohwada, Ryuichiro Ishitani, Junken Aoki, Osamu Nureki
Nature 548(7667) 356-360 2017年8月17日 査読有り
2016年
- A three-dimensional movie of structural changes in bacteriorhodopsin.
Eriko Nango, Antoine Royant, Minoru Kubo, Takanori Nakane, Cecilia Wickstrand, Tetsunari Kimura, Tomoyuki Tanaka, Kensuke Tono, Changyong Song, Rie Tanaka, Toshi Arima, Ayumi Yamashita, Jun Kobayashi, Toshiaki Hosaka, Eiichi Mizohata, Przemyslaw Nogly, Michihiro Sugahara, Daewoong Nam, Takashi Nomura, Tatsuro Shimamura, Dohyun Im, Takaaki Fujiwara, Yasuaki Yamanaka, Byeonghyun Jeon, Tomohiro Nishizawa, Kazumasa Oda, Masahiro Fukuda, Rebecka Andersson, Petra Båth, Robert Dods, Jan Davidsson, Shigeru Matsuoka, Satoshi Kawatake, Michio Murata, Osamu Nureki, Shigeki Owada, Takashi Kameshima, Takaki Hatsui, Yasumasa Joti, Gebhard Schertler, Makina Yabashi, Ana-Nicoleta Bondar, Jörg Standfuss, Richard Neutze, So Iwata
Science (New York, N.Y.) 354(6319) 1552-1557 2016年12月23日 査読有り - Activation mechanism of endothelin ETB receptor by endothelin-1.
Wataru Shihoya, Tomohiro Nishizawa, Akiko Okuta, Kazutoshi Tani, Naoshi Dohmae, Yoshinori Fujiyoshi, Osamu Nureki, Tomoko Doi
Nature 537(7620) 363-368 2016年9月15日 査読有り - Structural basis for amino acid export by DMT superfamily transporter YddG.
Hirotoshi Tsuchiya, Shintaro Doki, Mizuki Takemoto, Tatsuya Ikuta, Takashi Higuchi, Keita Fukui, Yoshihiro Usuda, Eri Tabuchi, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto, Tomohiro Nishizawa, Koichi Ito, Naoshi Dohmae, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki
Nature 534(7607) 417-20 2016年6月16日 査読有り
2015年
- Structural basis for Na(+) transport mechanism by a light-driven Na(+) pump.
Hideaki E Kato, Keiichi Inoue, Rei Abe-Yoshizumi, Yoshitaka Kato, Hikaru Ono, Masae Konno, Shoko Hososhima, Toru Ishizuka, Mohammad Razuanul Hoque, Hirofumi Kunitomo, Jumpei Ito, Susumu Yoshizawa, Keitaro Yamashita, Mizuki Takemoto, Tomohiro Nishizawa, Reiya Taniguchi, Kazuhiro Kogure, Andrés D Maturana, Yuichi Iino, Hiromu Yawo, Ryuichiro Ishitani, Hideki Kandori, Osamu Nureki
Nature 521(7550) 48-53 2015年5月7日 査読有り - Structural basis for the facilitative diffusion mechanism by SemiSWEET transporter.
Yongchan Lee, Tomohiro Nishizawa, Keitaro Yamashita, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki
Nature communications 6 6112-6112 2015年1月19日 査読有り
2014年
- Structural basis for ion selectivity revealed by high-resolution crystal structure of Mg2+ channel MgtE.
Hironori Takeda, Motoyuki Hattori, Tomohiro Nishizawa, Keitaro Yamashita, Syed T A Shah, Martin Caffrey, Andrés D Maturana, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki
Nature communications 5 5374-5374 2014年11月4日 査読有り - Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of YidC, a membrane-protein chaperone and insertase from Bacillus halodurans.
Kaoru Kumazaki, Tomoya Tsukazaki, Tomohiro Nishizawa, Yoshiki Tanaka, Hideaki E Kato, Yoshiko Nakada-Nakura, Kunio Hirata, Yoshihiro Mori, Hiroaki Suga, Naoshi Dohmae, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki
Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications 70(Pt 8) 1056-60 2014年8月 査読有り - Crystal structure of a claudin provides insight into the architecture of tight junctions.
Hiroshi Suzuki, Tomohiro Nishizawa, Kazutoshi Tani, Yuji Yamazaki, Atsushi Tamura, Ryuichiro Ishitani, Naoshi Dohmae, Sachiko Tsukita, Osamu Nureki, Yoshinori Fujiyoshi
Science (New York, N.Y.) 344(6181) 304-7 2014年4月18日 査読有り
2013年
- Structural basis for the counter-transport mechanism of a H+/Ca2+ exchanger.
Tomohiro Nishizawa, Satomi Kita, Andrés D Maturana, Noritaka Furuya, Kunio Hirata, Go Kasuya, Satoshi Ogasawara, Naoshi Dohmae, Takahiro Iwamoto, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki
Science (New York, N.Y.) 341(6142) 168-72 2013年7月12日 査読有り - 1P034 Structural Basis for the Counter-Transport Mechanism of a H^+/Ca^<2+> Exchanger(01B. Protein:Structure & Function,Poster)
Tomohiro Nishizawa, Satomi Kita, Andres Maturana, Noritaka Furuya, Kunio Hirata, Go Kasuya, Satoshi Ogawsawara, Naoshi Dohmae, Takahiro Iwamoto, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki
Seibutsu Butsuri 53(supplement1-2) S111 2013年 査読有り
2012年
- Structure and function of Zucchini endoribonuclease in piRNA biogenesis.
Hiroshi Nishimasu, Hirotsugu Ishizu, Kuniaki Saito, Satoshi Fukuhara, Miharu K Kamatani, Luc Bonnefond, Naoki Matsumoto, Tomohiro Nishizawa, Keita Nakanaga, Junken Aoki, Ryuichiro Ishitani, Haruhiko Siomi, Mikiko C Siomi, Osamu Nureki
Nature 491(7423) 284-7 2012年11月8日 査読有り - Crystal structure of the channelrhodopsin light-gated cation channel.
Hideaki E Kato, Feng Zhang, Ofer Yizhar, Charu Ramakrishnan, Tomohiro Nishizawa, Kunio Hirata, Jumpei Ito, Yusuke Aita, Tomoya Tsukazaki, Shigehiko Hayashi, Peter Hegemann, Andrés D Maturana, Ryuichiro Ishitani, Karl Deisseroth, Osamu Nureki
Nature 482(7385) 369-74 2012年1月22日 査読有り
2010年
- A Novel Ratchet Mechanism of Gastric H+,K+-ATPase Revealed by Electron Crystallography of Two-dimensional Crystals
Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Tomohiro Nishizawa, Yoshinori Fujiyoshi
YAKUGAKU ZASSHI-JOURNAL OF THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN 130(2) 205-210 2010年2月 査読有り
2009年
- Inter-subunit interaction of gastric H+,K+-ATPase prevents reverse reaction of the transport cycle.
Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Tomohiro Nishizawa, Yoshinori Fujiyoshi
The EMBO journal 28(11) 1637-43 2009年6月3日 査読有り
2008年
- Structural analysis of 2D crystals of gastric H+,K+-ATPase in different states of the transport cycle.
Tomohiro Nishizawa, Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi
Journal of structural biology 162(2) 219-28 2008年5月 査読有り
MISC
2021年
- ヒトメラトニン受容体シグナル伝達複合体のクライオ電子顕微鏡による単粒子解析
岡本紘幸, 宮内弘剛, 井上飛鳥, RAIMONDI Francesco, 辻本浩一, 草木迫司, 志甫谷渉, 山下恵太郎, 山下恵太郎, 寿野良二, 小林拓也, 岩田想, 岩田想, 西澤知宏, 濡木理
日本生化学会大会(Web) 94th 2021年
2020年
- 『細胞死を司るポンプ』脂質フリッパーゼATP11Cの結晶構造とCryo-EM構造
中西華代, 西澤知宏, 瀬川勝盛, 濡木理, 藤吉好則, 長田重一, 阿部一啓, 阿部一啓
日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 46th 2020年
2019年
- X線自由電子レーザーによるチャネルロドプシンの時分割構造解析
小田和正, 野村高志, 野村高志, 中根崇智, 中根崇智, 西澤知宏, 久保稔, 久保稔, 南後恵理子, 南後恵理子, 島村達郎, 石神一貴, 生田達也, 井爪珠希, 江熊龍雲, 岩田想, 岩田想, 濡木理
日本細胞生物学会大会(Web) 71st 2019年 - X線自由電子レーザーによるチャネルロドプシンの時分割構造解析
小田和正, 野村高志, 野村高志, 中根崇智, 西澤知宏, 久保稔, 久保稔, 南後恵理子, 南後恵理子, 島村達郎, 岩田想, 濡木理
日本結晶学会年会講演要旨集 2019 2019年
2017年
- 結晶構造から理解するGPCRの活性化機構 (第5土曜特集 生命現象を観る : 革新的な構造生命科学が観せてくれる世界) — (X線)
西澤 知宏
医学のあゆみ 262(5) 343-348 2017年7月29日
2016年
- エンドセリン-1によるエンドセリンＢ受容体の活性化機構
西澤知宏, 志甫谷渉, 奥田明子, 谷一寿, 藤吉好則, 土井知子
第39回分子生物学会 2016年11月 - エンドセリン受容体B型によるエンドセリン認識の構造基盤
志甫谷渉, 西澤知宏, 奥田明子, 谷一寿, 藤吉好則, 濡木理, 土井 知子
第39回分子生物学会 2016年11月 - 結晶構造から明らかになった、エンドセリン-1によるエンドセリン受容体B型の活性化機構
志甫谷渉, 西澤知宏, 奥田明子, 谷一寿, 藤吉好則, 濡木理, 土井 知子
第54回日本生物物理学会 （茨城） 2016年11月 - 臨床薬ボセンタンの結合したエンドセリン受容体B型の結晶構造
志甫谷渉, 西澤知宏, 奥田明子, 谷一寿, 藤吉好則, 濡木理, 土井 知子
第11回日本ケミカルバイオロジー学会 京都テルサホール 2016年6月 - 複数の結晶構造から明らかになった、エンドセリン受容体B型のリガンド認識機構
志甫谷渉, 西澤知宏, 奥田明子, 谷一寿, 藤吉好則, 濡木理, 土井 知子
第17回日本蛋白質学会 2016年6月
2015年
- ヒトエンドセリン受容体のＸ線結晶構造解析
志甫谷渉, 西澤知宏, 奥田明子, 谷一寿, 藤吉好則, 濡木理, 土井 知子
平成27年度日本結晶学会年会（大阪府立大学） 2015年10月
2013年
- Structural basis for molecular mechanism of calcium/proton exchanger transporter
Osamu Nureki, Tomohiro Nishizawa, Ryuichiro Ishitani, Takahiro Iwamoto
JOURNAL OF PHARMACOLOGICAL SCIENCES 121 26P-26P 2013年
2012年
- 光駆動性陽イオンチャネルであるチャネルロドプシンの結晶構造解析
加藤英明, ZHANG Feng, YIZHAR Ofer, RAMAKRISHNAN Charu, 西澤知宏, 平田邦生, 伊藤淳平, 相田雄亮, 塚崎智也, 林重彦, HEGEMANN Peter, MATURANA Andres, 石谷隆一郎, DAISSEROTH Kari, 濡木理
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 12th 87 2012年5月31日