| __________ | ___________________ | ___________ | __________ | __________ | _____ | _____ | _____ | _____ | _____ | _____ | _____ | _____ |
| table1 | ||||||||||||
| Subfamilies of EF-hands | ||||||||||||
| Subfamily | description | Kingdom | Function | Structure | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | ||
| Animal Plant Fungi Protist | ( | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | ) | ||||
| -- CTER --- | ||||||||||||
| CAM | calmodulin | APFP | + | X | + | + | + | +/- | ||||
| TNC | troponin C | A... | + | X | +/- | + | +/- | + | ||||
| ELC | essential light chain, myosin | A.F. | + | X | a/- | +/- | +/- | +/- | ||||
| RLC | regulatory light chain | A.FP | + | X | + | - | - | - | ||||
| TPNV | troponin, nonvertebrate | A... | + | ? | - | + | +/- | + | ||||
| CLAT | CAM-like leaf (Arabidopsis) | .P.. | ? | ? | + | + | + | + | *** | |||
| SQUD | squidulin (Loligo) | A... | + | ? | + | + | + | + | ||||
| CDC | CDC31 & caltractin | APFP | ? | ? | + | +/- | +/- | + | ||||
| CAL | cal1 (Caenorhabditis) | A... | ? | ? | + | + | + | + | ||||
| CAST | CAST | .P.. | ? | ? | *** | + | - | + | + | |||
| --- CPV --- | ||||||||||||
| CLNB | calcineurin B | A.F. | + | X | + | + | + | + | ||||
| P22 | p22 | A... | ? | ? | + | - | + | + | ||||
| VIS | visinin & recoverin | A... | + | X | - | + | + | - | ||||
| CALS | calsenilin (Homo) | A... | ? | ? | *** | - | - | + | + | |||
| DREM | DRE antag. modul. (Homo) | A... | + | ? | *** | -/? | +/? | + | + | |||
| CMPK | CAM dep prot kinase (Lilium) | .P.. | + | ? | *** | + | + | + | + | |||
| SOS3 | Ca sens homo (Arabidopsis) | .P.. | + | ? | - | - | - | - | ||||
| --- Pairings --- | ||||||||||||
| RTC | reticulocalbin (Mus) | A... | ? | ? | + | ?/+ | ?/+ | + | + | + | ||
| SCF | DNA supercoil fact (Bombyx) | A... | ? | ? | *** | + | - | + | + | + | + | |
| ------ | ||||||||||||
| CALP | calpain | A... | + | X | *** | + | + | - | - | - | ||
| SORC | sorcin / grancyclin | A.F. | + | ? | *** | + | + | - | - | - | ||
| ------ | ||||||||||||
| S100 | S100 | A... | ? | X | b/- | + | ||||||
| ICBP | intestinal Ca binding protein | A... | ? | X | b/- | + | ||||||
| HYFL | trichohylin profilag | A... | ? | ? | b/? | + | *** | |||||
| ------ | ||||||||||||
| DGK | diacylglycerol kinase | A... | + | ? | *** | + | + | *** | ||||
| NUBN | nucleobindin & NEFA | A... | ? | ? | *** | + | + | *** | ||||
| CRGP | CAM rel gene product (Homo) | A... | ? | ? | + | + | ||||||
| ------ | ||||||||||||
| ACTN | alpha-actinin | A.F. | + | ? | *** | +/- | +/- | |||||
| FDRN | alpha-spectrin & alpha-fodrin | A... | + | ? | *** | - | - | |||||
| ------ | ||||||||||||
| GPD | Glycerol-P-dehydrogenase | A... | + | ? | *** | - | + | |||||
| AIF1 | allograft inflammatory factor | A... | ? | ? | *** | + | +/? | |||||
| ------ | ||||||||||||
| BM40 | osteonectin, SPARK | A... | ? | X | *** | c | + | |||||
| QR1 | QR1 & SC1 | A... | ? | ? | - | + | ||||||
| --- Self --- | ||||||||||||
| EF12 | Ca Binding prot of nematodes | A... | ? | ? | *** | + | + | + | - | + | + | |
| + | + | + | + | + | + | |||||||
| LPS | L. pictus SPEC resembl prot | A... | ? | ? | + | + | + | + | + | + | ||
| + | - | |||||||||||
| CLBN | calbindin 28kDa, calretinin | A... | ? | ? | + | +/- | + | + | + | - | ||
| EP15 | EP15 | A... | ? | ? | - | - | - | + | + | - | ||
| TCBP | Tetrahymena CaBP | ...P | ? | ? | - | + | + | + | ||||
| P26 | p260lf (Rana) | A... | ? | ? | - | - | *** | - | - | |||
| PLC | phopholipase C | A.F. | + | X | *** | - | - | - | - | *** | ||
| CBP | CBP1, CBP2 (Dictyostelium) | ..F. | ? | ? | + | + | + | + | ||||
| --- Miscellaneous --- | ||||||||||||
| PFS | surface protein (Plasmodium) | ...P | ? | ? | *** | + | + | + | + | + | - | *** |
| CDPK | Ca dependent protein kinase | .P.. | + | ? | *** | + | + | + | + | |||
| PFPK | protein kinase (Plasmodium) | ...P | + | ? | *** | + | + | + | + | |||
| SPEC | Strongylocentrotus CaBP | A... | ? | ? | +/- | + | + | +/- | ||||
| TPP | p24 thyroid protein | A... | ? | ? | + | + | + | ? | ||||
| 1F8 | 1F8 & TB17 & calflagin | ...P | ? | ? | + | + | + | + | ||||
| SARC | sarcoplasm Ca bind prot | A... | ? | X | + | +/- | + | +/- | ||||
| AEQ | aequorin & luciferin BP | A... | + | X | + | *-* | + | + | ||||
| PPTS | protein phosphatase | A... | + | ? | *** | - | *-* | + | + | |||
| H32 | HRA32 (Phaseolus) | .P.. | ? | ? | + | + | + | + | ||||
| EFH5 | EFH5 | ...P | ? | ? | - | +/- | +/- | - | ||||
| CVP | Ca vector P (Branchiostoma) | A... | ? | ? | - | - | + | + | ||||
| PMAT | memb. assoc. (Arabidopsis) | .P.. | ? | ? | *** | + | + | + | + | |||
| LAV | LAV1 (Physarum) | ..F. | ? | ? | *** | + | + | + | + | |||
| CMSE | CaBP (Saccharopolyspora) | bact | ? | ? | + | + | + | + | ||||
| MSV | MSV097 (Entomopoxvirinae) | virus | ? | ? | + | + | - | - | ||||
| PARV | parvalbumin | A... | ? | X | del | - | + | + | ||||
| FIMB | fimbrin | A.F. | + | ? | +/- | +/- | *** | |||||
| GRP | ras GRP (Rattus) | A... | ? | ? | *** | +/? | +/? | *** | ||||
| PKD | PKD2L / polycystin | A... | ? | ? | *** | - | + | *** | ||||
| RYR | ryanodine R / Ca release | A... | + | ? | *** | - | + | *** | ||||
| CBL | proto-oncogene Cbl | A... | + | X | *** | - | d | *** | ||||
| CIB | Ca & integrin BP | A... | ? | ? | *** | + | + | |||||
| SENS | calsensin (Haemopsis) | A... | ? | ? | + | + | ||||||
| GRV | groovin (Drosophila) | A... | ? | ? | + | + | ||||||
| update: Oct. 06, 2000 | ||||||||||||
| __________ | ___________________ | ___________ | __________ | __________ | _____ | _____ | _____ | _____ | _____ | _____ | _____ | _____ |